Protein–RNA interactions for Protein: A0PK05

TMEM72, Transmembrane protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM72A0PK05 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM72A0PK05 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM72A0PK05 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM72A0PK05 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM72A0PK05 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM72A0PK05 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM72A0PK05 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM72A0PK05 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM72A0PK05 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM72A0PK05 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM72A0PK05 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM72A0PK05 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM72A0PK05 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM72A0PK05 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM72A0PK05 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM72A0PK05 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM72A0PK05 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM72A0PK05 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM72A0PK05 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM72A0PK05 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM72A0PK05 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM72A0PK05 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM72A0PK05 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM72A0PK05 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM72A0PK05 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM72A0PK05 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM72A0PK05 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM72A0PK05 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM72A0PK05 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM72A0PK05 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM72A0PK05 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM72A0PK05 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM72A0PK05 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM72A0PK05 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM72A0PK05 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM72A0PK05 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM72A0PK05 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM72A0PK05 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM72A0PK05 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM72A0PK05 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM72A0PK05 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM72A0PK05 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM72A0PK05 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM72A0PK05 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM72A0PK05 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM72A0PK05 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM72A0PK05 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMEM72A0PK05 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMEM72A0PK05 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMEM72A0PK05 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMEM72A0PK05 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMEM72A0PK05 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMEM72A0PK05 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMEM72A0PK05 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMEM72A0PK05 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMEM72A0PK05 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM72A0PK05 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM72A0PK05 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM72A0PK05 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM72A0PK05 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM72A0PK05 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM72A0PK05 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM72A0PK05 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM72A0PK05 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM72A0PK05 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM72A0PK05 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM72A0PK05 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM72A0PK05 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM72A0PK05 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM72A0PK05 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM72A0PK05 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM72A0PK05 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM72A0PK05 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM72A0PK05 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM72A0PK05 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM72A0PK05 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM72A0PK05 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM72A0PK05 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM72A0PK05 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM72A0PK05 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM72A0PK05 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM72A0PK05 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM72A0PK05 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM72A0PK05 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM72A0PK05 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM72A0PK05 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM72A0PK05 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM72A0PK05 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM72A0PK05 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM72A0PK05 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM72A0PK05 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM72A0PK05 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM72A0PK05 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM72A0PK05 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM72A0PK05 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM72A0PK05 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM72A0PK05 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM72A0PK05 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM72A0PK05 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM72A0PK05 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms