Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6N4

TRBV25-1, T-cell receptor beta variable 25-1 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV25-1A0A075B6N4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV25-1A0A075B6N4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV25-1A0A075B6N4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV25-1A0A075B6N4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV25-1A0A075B6N4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV25-1A0A075B6N4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV25-1A0A075B6N4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV25-1A0A075B6N4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV25-1A0A075B6N4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV25-1A0A075B6N4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV25-1A0A075B6N4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV25-1A0A075B6N4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV25-1A0A075B6N4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV25-1A0A075B6N4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV25-1A0A075B6N4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV25-1A0A075B6N4 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV25-1A0A075B6N4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV25-1A0A075B6N4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV25-1A0A075B6N4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV25-1A0A075B6N4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV25-1A0A075B6N4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRBV25-1A0A075B6N4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRBV25-1A0A075B6N4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRBV25-1A0A075B6N4 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRBV25-1A0A075B6N4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRBV25-1A0A075B6N4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRBV25-1A0A075B6N4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRBV25-1A0A075B6N4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRBV25-1A0A075B6N4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
TRBV25-1A0A075B6N4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV25-1A0A075B6N4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms