Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y223

GNE, Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNEQ9Y223 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GNEQ9Y223 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GNEQ9Y223 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms