Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM35Q9UPQ4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27.58■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM35Q9UPQ4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms