Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PNMA2Q9UL42 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PNMA2Q9UL42 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms