Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ68

MSRA, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRAQ9UJ68 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSRAQ9UJ68 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSRAQ9UJ68 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSRAQ9UJ68 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSRAQ9UJ68 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSRAQ9UJ68 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSRAQ9UJ68 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSRAQ9UJ68 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSRAQ9UJ68 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSRAQ9UJ68 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSRAQ9UJ68 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSRAQ9UJ68 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MSRAQ9UJ68 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MSRAQ9UJ68 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSRAQ9UJ68 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSRAQ9UJ68 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSRAQ9UJ68 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MSRAQ9UJ68 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSRAQ9UJ68 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSRAQ9UJ68 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSRAQ9UJ68 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSRAQ9UJ68 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSRAQ9UJ68 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MSRAQ9UJ68 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MSRAQ9UJ68 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSRAQ9UJ68 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSRAQ9UJ68 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSRAQ9UJ68 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MSRAQ9UJ68 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MSRAQ9UJ68 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms