Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGQ2

CACFD1, Calcium channel flower homolog, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACFD1Q9UGQ2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACFD1Q9UGQ2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACFD1Q9UGQ2 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACFD1Q9UGQ2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACFD1Q9UGQ2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACFD1Q9UGQ2 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACFD1Q9UGQ2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACFD1Q9UGQ2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACFD1Q9UGQ2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CACFD1Q9UGQ2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACFD1Q9UGQ2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACFD1Q9UGQ2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms