Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY4

DNAJB4, DnaJ homolog subfamily B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB4Q9UDY4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAJB4Q9UDY4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAJB4Q9UDY4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms