Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
COPS7AQ9UBW8 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COPS7AQ9UBW8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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