Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBV8

PEF1, Peflin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEF1Q9UBV8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEF1Q9UBV8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms