Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
XCL2Q9UBD3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms