Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2D1

CHD7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD7Q9P2D1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHD7Q9P2D1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms