Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

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Length 651 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RRN3Q9NYV6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRN3Q9NYV6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRN3Q9NYV6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRN3Q9NYV6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRN3Q9NYV6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRN3Q9NYV6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRN3Q9NYV6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRN3Q9NYV6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRN3Q9NYV6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRN3Q9NYV6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRN3Q9NYV6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRN3Q9NYV6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRN3Q9NYV6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRN3Q9NYV6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRN3Q9NYV6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRN3Q9NYV6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRN3Q9NYV6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRN3Q9NYV6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRN3Q9NYV6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRN3Q9NYV6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRN3Q9NYV6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRN3Q9NYV6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRN3Q9NYV6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRN3Q9NYV6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RRN3Q9NYV6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RRN3Q9NYV6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RRN3Q9NYV6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RRN3Q9NYV6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RRN3Q9NYV6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RRN3Q9NYV6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RRN3Q9NYV6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RRN3Q9NYV6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RRN3Q9NYV6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RRN3Q9NYV6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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