Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXW9

ALKBH4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH4Q9NXW9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALKBH4Q9NXW9 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ALKBH4Q9NXW9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ALKBH4Q9NXW9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALKBH4Q9NXW9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALKBH4Q9NXW9 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALKBH4Q9NXW9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALKBH4Q9NXW9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALKBH4Q9NXW9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALKBH4Q9NXW9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALKBH4Q9NXW9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALKBH4Q9NXW9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALKBH4Q9NXW9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALKBH4Q9NXW9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ALKBH4Q9NXW9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALKBH4Q9NXW9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALKBH4Q9NXW9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALKBH4Q9NXW9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ALKBH4Q9NXW9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALKBH4Q9NXW9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ALKBH4Q9NXW9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALKBH4Q9NXW9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALKBH4Q9NXW9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALKBH4Q9NXW9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALKBH4Q9NXW9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALKBH4Q9NXW9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALKBH4Q9NXW9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALKBH4Q9NXW9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALKBH4Q9NXW9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms