Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MS4A12Q9NXJ0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MS4A12Q9NXJ0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms