Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC3

SLC38A7, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 7, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A7Q9NVC3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC38A7Q9NVC3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC38A7Q9NVC3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC38A7Q9NVC3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms