Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX2

MRPL17, 39S ribosomal protein L17, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL17Q9NRX2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL17Q9NRX2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL17Q9NRX2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL17Q9NRX2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL17Q9NRX2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL17Q9NRX2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL17Q9NRX2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL17Q9NRX2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL17Q9NRX2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL17Q9NRX2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL17Q9NRX2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL17Q9NRX2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL17Q9NRX2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL17Q9NRX2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL17Q9NRX2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL17Q9NRX2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL17Q9NRX2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL17Q9NRX2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL17Q9NRX2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL17Q9NRX2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL17Q9NRX2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL17Q9NRX2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL17Q9NRX2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL17Q9NRX2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL17Q9NRX2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL17Q9NRX2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL17Q9NRX2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL17Q9NRX2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL17Q9NRX2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL17Q9NRX2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL17Q9NRX2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL17Q9NRX2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL17Q9NRX2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL17Q9NRX2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MRPL17Q9NRX2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MRPL17Q9NRX2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MRPL17Q9NRX2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MRPL17Q9NRX2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL17Q9NRX2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL17Q9NRX2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL17Q9NRX2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL17Q9NRX2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL17Q9NRX2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL17Q9NRX2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL17Q9NRX2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL17Q9NRX2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL17Q9NRX2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL17Q9NRX2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL17Q9NRX2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL17Q9NRX2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL17Q9NRX2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL17Q9NRX2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL17Q9NRX2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL17Q9NRX2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL17Q9NRX2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL17Q9NRX2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL17Q9NRX2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL17Q9NRX2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL17Q9NRX2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL17Q9NRX2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL17Q9NRX2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL17Q9NRX2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL17Q9NRX2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL17Q9NRX2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL17Q9NRX2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL17Q9NRX2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL17Q9NRX2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL17Q9NRX2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL17Q9NRX2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL17Q9NRX2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL17Q9NRX2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL17Q9NRX2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL17Q9NRX2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL17Q9NRX2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL17Q9NRX2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL17Q9NRX2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL17Q9NRX2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL17Q9NRX2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL17Q9NRX2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL17Q9NRX2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL17Q9NRX2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL17Q9NRX2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL17Q9NRX2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL17Q9NRX2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL17Q9NRX2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL17Q9NRX2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL17Q9NRX2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL17Q9NRX2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL17Q9NRX2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL17Q9NRX2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL17Q9NRX2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL17Q9NRX2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL17Q9NRX2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL17Q9NRX2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL17Q9NRX2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL17Q9NRX2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL17Q9NRX2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL17Q9NRX2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL17Q9NRX2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL17Q9NRX2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms