Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
A4GALTQ9NPC4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
A4GALTQ9NPC4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
A4GALTQ9NPC4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
A4GALTQ9NPC4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
A4GALTQ9NPC4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
A4GALTQ9NPC4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
A4GALTQ9NPC4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
A4GALTQ9NPC4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
A4GALTQ9NPC4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
A4GALTQ9NPC4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
A4GALTQ9NPC4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
A4GALTQ9NPC4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
A4GALTQ9NPC4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
A4GALTQ9NPC4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
A4GALTQ9NPC4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
A4GALTQ9NPC4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
A4GALTQ9NPC4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
A4GALTQ9NPC4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
A4GALTQ9NPC4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
A4GALTQ9NPC4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
A4GALTQ9NPC4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
A4GALTQ9NPC4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
A4GALTQ9NPC4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
A4GALTQ9NPC4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
A4GALTQ9NPC4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
A4GALTQ9NPC4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.73
A4GALTQ9NPC4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
A4GALTQ9NPC4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
A4GALTQ9NPC4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
A4GALTQ9NPC4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
A4GALTQ9NPC4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms