Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP79

VTA1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTA1Q9NP79 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VTA1Q9NP79 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VTA1Q9NP79 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VTA1Q9NP79 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
VTA1Q9NP79 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VTA1Q9NP79 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VTA1Q9NP79 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VTA1Q9NP79 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VTA1Q9NP79 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VTA1Q9NP79 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VTA1Q9NP79 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VTA1Q9NP79 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VTA1Q9NP79 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VTA1Q9NP79 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VTA1Q9NP79 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VTA1Q9NP79 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VTA1Q9NP79 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
VTA1Q9NP79 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
VTA1Q9NP79 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
VTA1Q9NP79 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VTA1Q9NP79 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms