Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAS3

SLC28A3, Solute carrier family 28 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A3Q9HAS3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC28A3Q9HAS3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC28A3Q9HAS3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC28A3Q9HAS3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC28A3Q9HAS3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC28A3Q9HAS3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC28A3Q9HAS3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC28A3Q9HAS3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC28A3Q9HAS3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC28A3Q9HAS3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC28A3Q9HAS3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC28A3Q9HAS3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC28A3Q9HAS3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC28A3Q9HAS3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC28A3Q9HAS3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC28A3Q9HAS3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC28A3Q9HAS3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC28A3Q9HAS3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC28A3Q9HAS3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC28A3Q9HAS3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC28A3Q9HAS3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC28A3Q9HAS3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC28A3Q9HAS3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms