Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLSTN2Q9H4D0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms