Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PDGFDQ9GZP0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms