Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
RNF17Q9BXT8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
RNF17Q9BXT8 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
RNF17Q9BXT8 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
RNF17Q9BXT8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
RNF17Q9BXT8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
RNF17Q9BXT8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
RNF17Q9BXT8 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
RNF17Q9BXT8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
RNF17Q9BXT8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
RNF17Q9BXT8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
RNF17Q9BXT8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
RNF17Q9BXT8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
RNF17Q9BXT8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.58
RNF17Q9BXT8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
RNF17Q9BXT8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
RNF17Q9BXT8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
RNF17Q9BXT8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
RNF17Q9BXT8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
RNF17Q9BXT8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
RNF17Q9BXT8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
RNF17Q9BXT8 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
RNF17Q9BXT8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
RNF17Q9BXT8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
RNF17Q9BXT8 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
RNF17Q9BXT8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
RNF17Q9BXT8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
RNF17Q9BXT8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
RNF17Q9BXT8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
RNF17Q9BXT8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
RNF17Q9BXT8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
RNF17Q9BXT8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
RNF17Q9BXT8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
RNF17Q9BXT8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
RNF17Q9BXT8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
RNF17Q9BXT8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
RNF17Q9BXT8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
RNF17Q9BXT8 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
RNF17Q9BXT8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
RNF17Q9BXT8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
RNF17Q9BXT8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
RNF17Q9BXT8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
RNF17Q9BXT8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
RNF17Q9BXT8 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
RNF17Q9BXT8 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
RNF17Q9BXT8 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC31.16■■■□□ 2.58
RNF17Q9BXT8 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
RNF17Q9BXT8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
RNF17Q9BXT8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
RNF17Q9BXT8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
RNF17Q9BXT8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
RNF17Q9BXT8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
RNF17Q9BXT8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
RNF17Q9BXT8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
RNF17Q9BXT8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
RNF17Q9BXT8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
RNF17Q9BXT8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
RNF17Q9BXT8 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
RNF17Q9BXT8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
RNF17Q9BXT8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
RNF17Q9BXT8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
RNF17Q9BXT8 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
RNF17Q9BXT8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
RNF17Q9BXT8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
RNF17Q9BXT8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
RNF17Q9BXT8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
RNF17Q9BXT8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
RNF17Q9BXT8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
RNF17Q9BXT8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
RNF17Q9BXT8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
RNF17Q9BXT8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
RNF17Q9BXT8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
RNF17Q9BXT8 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
RNF17Q9BXT8 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
RNF17Q9BXT8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
RNF17Q9BXT8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
RNF17Q9BXT8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
RNF17Q9BXT8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
RNF17Q9BXT8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
RNF17Q9BXT8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
RNF17Q9BXT8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
RNF17Q9BXT8 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
RNF17Q9BXT8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
RNF17Q9BXT8 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC31.12■■■□□ 2.57
RNF17Q9BXT8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
RNF17Q9BXT8 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
RNF17Q9BXT8 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
RNF17Q9BXT8 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
RNF17Q9BXT8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
RNF17Q9BXT8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
RNF17Q9BXT8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
RNF17Q9BXT8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
RNF17Q9BXT8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
RNF17Q9BXT8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
RNF17Q9BXT8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
RNF17Q9BXT8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
RNF17Q9BXT8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
RNF17Q9BXT8 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
RNF17Q9BXT8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
RNF17Q9BXT8 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms