Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRZ2

TRIM56, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM56, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM56Q9BRZ2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM56Q9BRZ2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms