Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOXF2Q9BQY4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms