Protein–RNA interactions for Protein: Q96NU1

SAMD11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD11Q96NU1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SAMD11Q96NU1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAMD11Q96NU1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms