Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALPK3Q96L96 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms