Protein–RNA interactions for Protein: Q96KP6

TNIP3, TNFAIP3-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP3Q96KP6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNIP3Q96KP6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNIP3Q96KP6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms