Protein–RNA interactions for Protein: Q96KK3

KCNS1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, humanhuman

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Length 526 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS1Q96KK3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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KCNS1Q96KK3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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KCNS1Q96KK3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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KCNS1Q96KK3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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KCNS1Q96KK3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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KCNS1Q96KK3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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KCNS1Q96KK3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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KCNS1Q96KK3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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KCNS1Q96KK3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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