Protein–RNA interactions for Protein: Q96I25

RBM17, Splicing factor 45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM17Q96I25 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBM17Q96I25 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RBM17Q96I25 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms