Protein–RNA interactions for Protein: Q96EU6

RRP36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP36Q96EU6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRP36Q96EU6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms