Protein–RNA interactions for Protein: Q96CJ1

EAF2, ELL-associated factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF2Q96CJ1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
EAF2Q96CJ1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EAF2Q96CJ1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EAF2Q96CJ1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms