Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PRG4Q92954 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PRG4Q92954 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PRG4Q92954 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PRG4Q92954 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PRG4Q92954 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PRG4Q92954 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
PRG4Q92954 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC34■■■■□ 3.03
PRG4Q92954 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PRG4Q92954 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
PRG4Q92954 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
PRG4Q92954 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
PRG4Q92954 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PRG4Q92954 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PRG4Q92954 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PRG4Q92954 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PRG4Q92954 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PRG4Q92954 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
PRG4Q92954 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PRG4Q92954 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PRG4Q92954 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PRG4Q92954 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PRG4Q92954 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PRG4Q92954 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PRG4Q92954 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PRG4Q92954 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PRG4Q92954 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PRG4Q92954 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PRG4Q92954 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PRG4Q92954 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PRG4Q92954 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PRG4Q92954 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PRG4Q92954 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PRG4Q92954 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PRG4Q92954 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PRG4Q92954 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PRG4Q92954 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PRG4Q92954 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PRG4Q92954 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PRG4Q92954 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
PRG4Q92954 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PRG4Q92954 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PRG4Q92954 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PRG4Q92954 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PRG4Q92954 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PRG4Q92954 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PRG4Q92954 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PRG4Q92954 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PRG4Q92954 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PRG4Q92954 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
PRG4Q92954 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
PRG4Q92954 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
PRG4Q92954 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PRG4Q92954 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PRG4Q92954 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PRG4Q92954 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PRG4Q92954 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
PRG4Q92954 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
PRG4Q92954 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
PRG4Q92954 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
PRG4Q92954 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
PRG4Q92954 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
PRG4Q92954 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
PRG4Q92954 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
PRG4Q92954 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PRG4Q92954 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PRG4Q92954 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
PRG4Q92954 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PRG4Q92954 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PRG4Q92954 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PRG4Q92954 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PRG4Q92954 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PRG4Q92954 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PRG4Q92954 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PRG4Q92954 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PRG4Q92954 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PRG4Q92954 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PRG4Q92954 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PRG4Q92954 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PRG4Q92954 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
PRG4Q92954 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PRG4Q92954 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PRG4Q92954 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PRG4Q92954 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PRG4Q92954 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PRG4Q92954 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
PRG4Q92954 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PRG4Q92954 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PRG4Q92954 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PRG4Q92954 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PRG4Q92954 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PRG4Q92954 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
PRG4Q92954 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PRG4Q92954 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PRG4Q92954 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PRG4Q92954 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PRG4Q92954 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PRG4Q92954 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PRG4Q92954 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PRG4Q92954 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms