Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC4Q8WW27 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms