Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRSK1Q8TDC3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRSK1Q8TDC3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRSK1Q8TDC3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
BRSK1Q8TDC3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
BRSK1Q8TDC3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRSK1Q8TDC3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRSK1Q8TDC3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRSK1Q8TDC3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRSK1Q8TDC3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRSK1Q8TDC3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRSK1Q8TDC3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
BRSK1Q8TDC3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRSK1Q8TDC3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRSK1Q8TDC3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRSK1Q8TDC3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRSK1Q8TDC3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRSK1Q8TDC3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRSK1Q8TDC3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRSK1Q8TDC3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BRSK1Q8TDC3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BRSK1Q8TDC3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BRSK1Q8TDC3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BRSK1Q8TDC3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BRSK1Q8TDC3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BRSK1Q8TDC3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BRSK1Q8TDC3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BRSK1Q8TDC3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BRSK1Q8TDC3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
BRSK1Q8TDC3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRSK1Q8TDC3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRSK1Q8TDC3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRSK1Q8TDC3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRSK1Q8TDC3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRSK1Q8TDC3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRSK1Q8TDC3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRSK1Q8TDC3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRSK1Q8TDC3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRSK1Q8TDC3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRSK1Q8TDC3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRSK1Q8TDC3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRSK1Q8TDC3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRSK1Q8TDC3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRSK1Q8TDC3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRSK1Q8TDC3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRSK1Q8TDC3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRSK1Q8TDC3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRSK1Q8TDC3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRSK1Q8TDC3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BRSK1Q8TDC3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
BRSK1Q8TDC3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms