Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAN2

MIGA1, Mitoguardin 1, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIGA1Q8NAN2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MIGA1Q8NAN2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MIGA1Q8NAN2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MIGA1Q8NAN2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MIGA1Q8NAN2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MIGA1Q8NAN2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MIGA1Q8NAN2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MIGA1Q8NAN2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MIGA1Q8NAN2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MIGA1Q8NAN2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MIGA1Q8NAN2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MIGA1Q8NAN2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MIGA1Q8NAN2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MIGA1Q8NAN2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MIGA1Q8NAN2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MIGA1Q8NAN2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MIGA1Q8NAN2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms