Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms