Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC84Q86UT8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC84Q86UT8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms