Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMB3

Ppp1r3c, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3C, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r3cQ7TMB3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp1r3cQ7TMB3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppp1r3cQ7TMB3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms