Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HS2ST1Q7LGA3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HS2ST1Q7LGA3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms