Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
BBS12Q6ZW61 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BBS12Q6ZW61 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms