Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV50

RFX8, DNA-binding protein RFX8, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX8Q6ZV50 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RFX8Q6ZV50 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RFX8Q6ZV50 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms