Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGMBQ6NW40 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGMBQ6NW40 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGMBQ6NW40 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RGMBQ6NW40 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGMBQ6NW40 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGMBQ6NW40 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGMBQ6NW40 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGMBQ6NW40 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGMBQ6NW40 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RGMBQ6NW40 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RGMBQ6NW40 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RGMBQ6NW40 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGMBQ6NW40 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms