Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF123Q5XPI4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF123Q5XPI4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF123Q5XPI4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF123Q5XPI4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF123Q5XPI4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF123Q5XPI4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF123Q5XPI4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF123Q5XPI4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF123Q5XPI4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF123Q5XPI4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF123Q5XPI4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF123Q5XPI4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF123Q5XPI4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF123Q5XPI4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF123Q5XPI4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF123Q5XPI4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF123Q5XPI4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF123Q5XPI4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF123Q5XPI4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF123Q5XPI4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF123Q5XPI4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RNF123Q5XPI4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RNF123Q5XPI4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RNF123Q5XPI4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RNF123Q5XPI4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms