Protein–RNA interactions for Protein: Q5MNV8

FBXO47, F-box only protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO47Q5MNV8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO47Q5MNV8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO47Q5MNV8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO47Q5MNV8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO47Q5MNV8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO47Q5MNV8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO47Q5MNV8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO47Q5MNV8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO47Q5MNV8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO47Q5MNV8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO47Q5MNV8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO47Q5MNV8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO47Q5MNV8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO47Q5MNV8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO47Q5MNV8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO47Q5MNV8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO47Q5MNV8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO47Q5MNV8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO47Q5MNV8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO47Q5MNV8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO47Q5MNV8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO47Q5MNV8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO47Q5MNV8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO47Q5MNV8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO47Q5MNV8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO47Q5MNV8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO47Q5MNV8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO47Q5MNV8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO47Q5MNV8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO47Q5MNV8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO47Q5MNV8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO47Q5MNV8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO47Q5MNV8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO47Q5MNV8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO47Q5MNV8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO47Q5MNV8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO47Q5MNV8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO47Q5MNV8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO47Q5MNV8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO47Q5MNV8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO47Q5MNV8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO47Q5MNV8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO47Q5MNV8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO47Q5MNV8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO47Q5MNV8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO47Q5MNV8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO47Q5MNV8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO47Q5MNV8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO47Q5MNV8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO47Q5MNV8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO47Q5MNV8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO47Q5MNV8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO47Q5MNV8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO47Q5MNV8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO47Q5MNV8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO47Q5MNV8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO47Q5MNV8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO47Q5MNV8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO47Q5MNV8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO47Q5MNV8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO47Q5MNV8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO47Q5MNV8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO47Q5MNV8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO47Q5MNV8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO47Q5MNV8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO47Q5MNV8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms