Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PITRM1Q5JRX3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PITRM1Q5JRX3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
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