Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CDCA8Q53HL2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDCA8Q53HL2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CDCA8Q53HL2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CDCA8Q53HL2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CDCA8Q53HL2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDCA8Q53HL2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDCA8Q53HL2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDCA8Q53HL2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDCA8Q53HL2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CDCA8Q53HL2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CDCA8Q53HL2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDCA8Q53HL2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDCA8Q53HL2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDCA8Q53HL2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDCA8Q53HL2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDCA8Q53HL2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDCA8Q53HL2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDCA8Q53HL2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms