Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DUSP28Q4G0W2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DUSP28Q4G0W2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms