Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GEN1Q17RS7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GEN1Q17RS7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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