Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRNQ16849 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRNQ16849 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
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